克罗恩病影响的脏器包括：

1、主要影响消化道，包括口腔、食管、胃、小肠、大肠及肠外一些脏器；

2、影响肛门、肛周，出现肛周的脓肿或瘘管；

3、影响口腔，出现口腔溃疡；

4、影响关节，表现为关节疼痛；

5、影响眼睛，出现视物模糊、眼睛充血等，表现为巩膜炎或其他相关症状；

6、影响肝脏、血液系统，甚至影响儿童的生长发育。