性功能障碍检查、治疗费用根据病情而定，功能性障碍，检查和治疗费用大概几百到几千元。器质性的疾病，或者因肿瘤、特殊因素所导致的性功能障碍，需做CT或MR等进一步检查时，费用大概超过千元。

包茎、包皮过长而导致的功能性障碍的进行包皮环扎术，费用大概为两千元，器质性功能障碍手术，例如阴茎假体植入，手术费用大概为几万到十多万。