腹腔镜微创手术是大多数无其他合并症状普通患者首选，费用相对较少，患者入院总费用大约2-3万元。

如胃间质瘤患者同时合并有心肺、心脏或肺部等其他相关疾病则需术前进行相关系统评估和术后针对其合并疾病处理，此类患者总费用会有一定的浮动。此外，中高级危险因素患者出院之前有必要做肿瘤相关的基因检测，费用几千元到一万元不等。