输卵管积水可以分为轻、中、重度，在临床上首先要根据患者的意愿、输卵管的病变情况进行个体化治疗。如果输卵管积水比较轻，而且患者年轻，并且有自然怀孕的意愿，可以进行腹腔镜下输卵管整形术或者造口术；若输卵管病变严重，功能完全丧失，则应进行输卵管切除。但会损伤输卵管系膜的血管，进而对卵巢的血供造成影响，因此并不太适合卵巢功能下降的患者。
临床当中为了避免输卵管切除引起对卵巢功能的影响，可以采取输卵管近端结扎、远端造口术。输卵管积水还有其它的治疗方法，比如栓塞介入治疗。这种手术方法相对比较简单，创伤也小；输卵管积水还可以进行超声引导下的抽吸术，但术后容易复发。