对于肛周脓肿，每个医院的住院天数可能都不尽相同。对于比较小，比较浅的肛周脓肿，做完手术以后2-3天或3-4天可以出院回家休养，可口服抗生素，局部进行换药，或者坐浴、泡洗等。但是对于脓肿较大较深，而且位置较高，涉及肌间隙的范围较广的患者，相对住院时间较长，可能有时需要住院几十天，甚至几个月。一般，临床会综合考虑以上因素，对于营养不佳，或合并有其它疾病，比如糖尿病、结核，或服用免疫抑制剂的患者，会相应延长住院时间。需要向家属和患者做统一交代，让家属有思想准备，因为此类病人本身住院时间较长。