避孕药基本为雌激素、孕激素，可以模拟人工周期治疗月经不调。由于周期性雌激素和孕激素分泌不规律，导致月经不调。雌激素和孕激素是卵巢分泌，卵巢分泌受垂体和下丘脑调节。如果每个月经周期比较稳定，月经后雌激素分泌逐渐上升，内膜生长，到中间有排卵期。这时孕激素排卵后上升，雌、孕激素维持高位准备迎接妊娠，如果这时没有受孕，雌、孕激素下降，内膜无法支持后来月经，是正常的周期。
如果月经不调可能中间没有排卵，或者由于内膜长息肉或者其他因素引起，这时吃避孕药模拟人工周期，月经会比较准确。经过几个疗程抑制体内雌、孕激素分泌，让人体的下丘脑-垂体-卵巢轴休息一段时间，可能会逐渐调整。如果内膜不平整或者息肉导致月经不调，吃避孕药也会抑制内膜生长，息肉可能会脱落，达到治疗的目的。
