多数甲亢患者无需长期口服丙硫氧嘧啶，但复发的患者可能需小剂量长期维持，但由于使用剂量较小，所以不存在明显的不良反应。对于是否需要长期服用丙硫氧嘧啶，应根据专业医生的意见确定。甲亢的治疗主张足量足疗程，多数患者使用丙硫氧嘧啶的时间在1.5-2年，甚至可以延长至3-4年，但不会长期口服。

若患者在停药时出现复发，医生可能会嘱患者长期小剂量维持。但此时患者的服药剂量较小，每天仅服用0.5-1片，所以不会对机体造成过大影响。因为丙基硫氧嘧啶不会在体内蓄积，不良反应相对较少。虽然患者存在个体差异，对于药物较敏感的患者可能无法服用，但对于能够服用丙基硫氧嘧啶的患者，长期小剂量服用不存在明确的害处。