胆石症的发病机制仍然是外科界研究的热点。因为胆石症发病率很高，占人群的10%，特别是60岁以上的老人，发病率可能达到20%以上，因此全世界的外科家都给予了重视及很多探索。目前胆石症的发病机制仍然没有很明确，但是有以下几个研究的方向：

1、机体肝脏对代谢产物的代谢发生障碍：即以前中国人以吃素食为主，那时胆囊结石的发病率很低。随着近年来人们对动物蛋白进食量的大大增加，胆石症的发病率正逐渐上升，即可提示食物结构可导致胆囊结石发病率的升高；

2、胆道结构发生改变：即是解剖因素引起的胆结石。最明显的例子是肝内外胆管囊状扩张症。此病容易形成肝内结石或者胆总管结石。另外，胆囊的胆囊管过长，导致胆囊排空障碍，也可引起胆囊结石或者肝内胆管结石；

3、很多人不吃早点：其直接后果就是胆汁在胆道停留的时间比正常人要多四个小时，甚至六个小时，从而造成胆汁内固体成分的沉积可能性增大。所以也提示不吃早点的人群，其胆石症发病率，会比正常人群要高很多。