法洛四联症的术后并发症多由于术后恢复不佳导致，与患儿个体病情程度有关。术后患儿可出现瓣膜返流量较大，短期内可影响心功能；由于术中需体外循环麻醉，因此可出现抽搐、脑出血等脑部并发症，若症状较轻，经治疗后可得到治愈。随着手术水平的不断提高，一般情况下，若患儿符合法洛四联手术适应证，进行分期治疗，术中术者操作正常，则一般无并发症。