原发性痛经一般不会引起不孕，原发性痛经的患者一般排卵机制正常，但如果原发性痛经合并其他疾病，如子宫内膜异位症、子宫腺肌症、盆腔炎，病人盆腔环境发生改变，同时影响卵巢排卵及黄体形成。子宫内膜异位症、不孕症的发病率达40%以上，子宫腺肌症因子宫内膜环境改变可导致不孕。原发性痛经合并子宫内膜异位症，子宫腺肌病合并盆腔炎导致慢性输卵管炎，慢性输卵管通而不畅，甚至阻塞，会出现不孕。