胃壁间质瘤一经诊断，若未发生广泛转移，则可选靶向治疗或内镜下手术治疗，多不选用腔镜手术。若肿瘤大于2cm且50个高倍视野下核分裂象大于10个，恶性程度高于中危，则应行腹腔镜下胃部分切除术、胃壁间质瘤切除术或近端胃切除术。部分胃壁间质瘤需行全胃切除术，若肿瘤较大，且出现急腹症，则需先行开腹手术。胃间质瘤的治疗需严格遵循根治及无留原则，否则易发生腹腔转移和复发。