胃壁间质瘤手术效果主要取决于肿瘤分期，或其危险程度。胃间质瘤分为极低危、低危、中危和高危。极低危、中危的患者，腔镜手术切除后生存率较高，及时治疗后十年生存率能达到90%以上。中高危及高危患者，或者发生转移的患者，其生存率相对较低。胃间质瘤手术以后需用伊马替尼和二代、三代靶向药来控制其复发。靶向药即直达肿瘤，对身体其他细胞的副作用较小，可在一定程度增加治愈几率。