女性解脲支原体阳性，直接治疗是采用抗菌素进行治疗。针对性抗生素常用大环内酯类药物，包括罗红霉素、阿奇霉素、克拉霉素等。除采用抗生素治疗外，还可采用清热、利湿、解毒的中药及中成药辅助治疗，常用中成药有癃清片、银花泌炎灵、泌淋清、热淋清、八正胶囊等。在常用的中草药中，还可采用石韦、瞿麦、扁蓄、白茅根、车前草、金钱草等。
同时值得注意，如果女性的解脲支原体出现在泌尿部位，还属于性传播疾病的一种，称为非淋球菌性尿道炎。在治疗期间需要避免性生活，个人的贴身衣物还要单独清洗，通常建议将贴身衣物用开水煮沸后再进行进一步清洗，以减少病原体在夫妻双方之间的交叉感染。
