治疗肛瘘的外用药大部分选择中药。主要可以采用坐浴后服用中药的方法，包括清热解毒药物、医院内自制剂，如参黄袋泡剂，皆可减轻肛瘘引起的疼痛。但仍需在中药外用的基础上，及早采取手术治疗。因为仅依靠中医中药，只能缓解部分症状。若想彻底治愈肛瘘，需早期通过手术治疗，如中医挂线疗法、中医开窗留桥等方法。具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。