大部分脑炎彻底治愈后，常规不会复发。病毒性脑炎一般为自限性疾病，2周左右症状可缓解，未见复发。细菌性脑炎若在医生正确指导和治疗下，足疗程完成治疗周期以后，体温和复查脑脊液正常后没有其它临床表现，复发概率较低。

但其它特殊类型脑炎，如免疫性脑炎常起病未见发热，出现精神行为异常及抽搐，甚至睡眠障碍，此类患者治疗后有复发风险。