在胃镜下检查幽门螺杆菌可以分为快速尿素酶试验和病理组化检查，即嗜银染色，可以明确是否存在幽门螺杆菌的感染。如果是通过嗜银染色发现有幽门螺杆菌的感染，在临床上认为是金标准，提示肯定存在幽门螺杆菌感染，最为准确。但如果与快速尿素酶试验相比，呼气试验可能更客观、更准确，呼气试验得到的是检测阳性或阴性的一个数值。而快速尿素酶试验则是通过颜色的改变判断，如果颜色改变非常显著，结果呈(+++)，甚至(++++)，也可确定存在幽门螺杆菌感染。但如果结果是(+)，则不能明确判定是否存在幽门螺杆菌感染。
由此可见，胃镜检查Hp有可能会存在一些假阴性或假阳性的情况，而呼气试验是目前相对较为标准的检测方法。但如果受检者服用某些药物，如抗生素、铋剂或质子泵抑制剂，则可能会影响检查结果，因此，在进行呼气试验之前需要停用抗生素4周以上，停用各种治疗胃部的药物2周以上，才能保持检查结果的准确。
