脑干挫伤会遗留后遗症。因脑干是人脑的中枢，一旦发生损伤，预后较差。脑干挫伤后遗症主要与损伤程度、部位及患者自身状况有关。脑干轻度挫伤或非关键功能区挫伤，后遗症相对较轻，自身状况不同，挫伤后恢复程度存在个体差异；脑干挫伤程度较重可导致患者偏瘫、语言功能障碍、意识障碍、智力低下，甚至仅能达到2-3岁小儿的智力，甚至出现长期卧床、持续昏迷、植物状态。