脊索瘤的治疗方法包括手术切除、放疗、化疗、微波、射频消融等。手术切除最为重要，但是脊索瘤位置特殊，手术切除仅能控制疾病发展；放疗作用有限，脊索瘤对于放疗不敏感，加大剂量，临近器官无法耐受；对于化疗，仅部分分子靶向药物可以发挥作用，但是会产生耐药现象。此外，微波、射频消融仅能辅助治疗。总之，脊索瘤治疗效果不佳，仅能对症治疗缓解患者症状。