肠道常见致病菌包括埃希氏菌群、沙门氏菌群、志贺氏菌群。所谓侵袭性即细菌通过大肠上皮黏膜进入肠道上皮细胞，且在肠道上皮细胞内繁殖，其侵袭力比平常的感染会更重。肠道侵袭性感染治疗以抗菌素治疗为主，需选择针对肠道的厌氧菌及需氧菌的抗菌素，通常进行综合性治疗，或选择有特效的抗菌素，包括西药灌肠与中药灌肠等治疗方法。