胃间质瘤的手术方式有开刀手术、腹腔镜手术以及胃镜下手术。不同的情况，需要采取不同的手术方式。若间质瘤较小且位于黏膜下，可考虑进行胃镜下的黏膜剥除手术；若间质瘤相对较大，直径在5cm以下，可考虑进行腹腔镜的微创手术；若间质瘤直径超过5cm，则不推荐进行微创手术，如果手术过程中，肿瘤被切破，会造成间质瘤的种植，复发的几率也会明显的升高。