肾衰竭腰疼需结合病因处理，具体如下：

1、急性肾损伤：为最常见的病因，如肾小球疾病导致肾脏损伤，引起腰疼，可采用激素细胞毒药积极治疗；

2、慢性肾功能不全：如合并肾囊肿，且肾囊肿超过5-6cm，可通过囊肿内注射无水酒精或外科手术进行处理；

3、髓质海绵肾：即有肾结石，可根据患者病因采取排石治疗或外科手术治疗。