含牙囊肿的治疗，总体来讲，处于生长发育期的患儿，含牙囊肿较小，可采取手术治疗；含牙囊肿较大，位置比较特殊，首先需要开窗治疗，由于儿童成骨能力很强，开窗后绝大多数患儿，牙齿可自行萌出，囊肿消退，后期进行一个微小的根治术即可。对于成年人，囊肿长至上颌骨，与上颌窦相通，建议进行囊肿根治和上颌窦根治；长至下颌骨，则需要截骨根治。