血液灌流的并发症主要包括：

1、出血：灌流器增加可增加肝素使用量，易导致患者发生出血。若出血较少问题较轻，若出现严重的消化道出血或脑出血可危及生命；

2、血栓栓塞：抗凝剂使用剂量过小，可能会发生血栓栓塞。若栓塞发生在主要脏器，出现脑梗、心梗、肺梗，均为较严重的问题。但临床中机器存在传感器，一旦发生血栓，可及时报警清除血栓。