风湿热活动时间较长的患者通常有严重心脏炎症或舞蹈症，初次发病后5年内约有20%的患者复发，第一个5年复发率是10%，第三个5年复发率为5%，复发常在再次链球菌感染后出现。严重心脏炎症复发次数频繁、治疗不适当或不及时的患者，可出现顽固性心力衰竭、亚急性细菌性心内膜炎，或形成慢性风湿性心脏瓣膜病。急性风湿热预后取决于心脏病变严重程度、复发次数及治疗反应。急性风湿热初次发作时，约75%患者在6周内恢复，至12周至少有90%可以恢复。仅5%的患者，风湿病情活动持续超过6个月。
风湿热合并心脏炎并有永久性瓣膜病变者，必须在末次风湿热发作后持续预防用药10年或至少维持到40岁，或终身预防。风湿热合并心脏炎症而无瓣膜病变者，必须在末次风湿热发作后持续预防用药10年或以上，直至成年。无心脏受累的风湿热患者，从风湿热末次发作，至少维持预防用药5年或年满21岁。已经有心脏受累的风湿热患者，再次感染链球菌后，极易引起风湿活动，并且容易发生心脏的炎症，所以必须严格预防治疗。