用伽玛刀治疗相对于一些特定的肿瘤，可以达到一个比较好的治疗效果，伽玛刀治疗其实是一种放疗，是立体定向放疗，所以伽玛刀的副作用与放疗的副作用比较接近。从神经系统方面，主要的副作用就是放射性水肿。水肿部位就是在病灶周边，而且这种水肿不是放疗以后马上就出现，通常是在做了伽玛刀三四个月以后才会出现。一般在术后半年左右，放射性水肿达到一个峰值，这个时候水肿特别严重。
但因人而异，部分患者做了伽玛刀治疗，并没有出现特别明显、特别严重的水肿。但部分患者会出现比较严重的放射性水肿，严重到通过影像学检查，如磁共振、CT可以看到明显的低密度区，就是水肿的区域。当然，还有其他的副作用，比如特定区域的毛发增长问题，一般是毛发增长不那么旺盛，局部甚至出现了明显的稀疏，这是次要的副作用。
