新生儿肺动脉高压的病因大概有以下几点：

1、肺大动脉缩窄：引起血管阻力上升，导致肺动脉高压，它缩窄的原因主要有2个，肺血管适应不良，即缺氧、肺血管痉挛导致，是暂时性的症状，所以缺氧纠正以后，可能会恢复正常；宫内长期缺氧导致肺动脉的平滑肌增生，导致缩窄，这种情况可能会稍微较严重，治疗略麻烦；

2、肺血管床减少或者阻力增高：肺血管床减少，包括肺发育不良，比如有膈疝、肺发育不良、肺血管床减少，导致阻力升高。另外，红细胞增多症，使得血液黏滞度增高，导致血流阻力增高，也会导致肺动脉高压；

3、肺静脉回流受阻：流不出去，也会阻塞在这里，导致肺动脉高压，比如肺静脉异位引流，先天性心脏病等因素。