大多数川崎病是属于自限性疾病，也就是说经过病程，通过治疗是不会留下明显的后遗症。有一些如果累及心脏，冠脉有明显扩张或者形成冠脉瘤，就可能引起一些后遗症，主要是对于心脏方面的后遗症。冠脉扩张或者形成冠脉瘤，等成年以后有可能会通过比如感染或者剧烈运动，冠脉瘤就可能会出现破裂，破裂出血可能会导致心源性猝死或者心源性休克，这就是比较严重的后果。所以为了预防冠脉瘤的出现，在早期一旦确诊川崎病就一定要规范足量用药，并且在医生指导下进行定期生化结果和心脏彩超复查。其它在疾病后期可能会出现比如手脚脱皮或者肛周脱屑，这个改变很轻微，基本上多注意观察，可以慢慢消失，也不会有比较严重的后果。
