面肌痉挛的根本原因是由血管压迫面神经根部引起。面肌痉挛的发病机制，有两个主要的学说，一个是周围性学说，面神经外部是神经髓鞘，内部是神经纤维，在面神经根部位置没有神经髓鞘，仅是被部分少突胶质细胞所包围。血管在面神经根部跳动后，可能会发生异常的动作电位引起短路，引起面肌痉挛、面部的不自主抽搐。另一种是中枢性学说，血管压迫神经之后，会产生反向的神经冲动传导，传导到面神经核后，面神经又有一些变性，神经冲动无法传导下去，神经冲动会在面神经核蓄积，如果蓄积到一定程度，会引起突然间的释放，引起面肌抽搐。手术之后虽将血管与神经隔开，血管不在此位置跳动，但是面神经根部少突胶质细胞的恢复需要一定的时间，同时面神经核的冲动恢复趋于稳定也需要一段时间。所以面肌痉挛的迟发型治愈，在一个月之内，慢慢的此位置趋于稳定不再跳动，也有需要半年甚至一年，较长的需四年时间才停止跳动，大部分是在一年之内不再跳动。