实质性的器官恶性肿瘤分为癌和肉瘤两种。所谓的癌和肉瘤其实主要是指病理诊断上的不同，通常把从上皮来源的恶性组织称为癌，也就是平常讲的胃癌、结直肠癌，其实都是起源于胃上皮或者是结直肠的上皮，而把间叶组织来源的恶性肿瘤统称为肉瘤。胃肠间质瘤其实是来源于胃肠道未定向分化的间质细胞，属于间叶组织来源的肿瘤，因此称为间质瘤，而并不属于癌，但是和癌细胞的相同点，同样是属于恶性肿瘤。可以简单打个比方，就像西瓜一样，整个胃壁可能分为好几层，如果是最靠近里面的那一层细胞，发生了变化称之为癌。如果是靠近外面的这几层，发生了恶变可能是间质瘤或者是其它性质来源，比如间叶组织来源的肉瘤。但是无论是哪一种肿瘤，一定是需要手术切除或者在胃镜下进行活检，通过病理检查进行明确诊断。
