扁桃体隐窝是扁桃体表面的黏膜突入到扁桃体实质内形成。扁桃体隐窝在扁桃体实质内又分成许多囊性小支，小支旁边有很多淋巴滤泡和淋巴组织。隐窝里面会储存细菌，引起感染，形成感染病灶。有炎症的时候扁桃体滤泡红肿、肿胀，可以看到扁桃体肿大。如果滤泡增生化脓，黏膜上可以看到黄白色小点。如果扁桃体隐窝内出现炎性改变、炎性渗出化脓，扁桃体表面可以看到成片脓性分泌物。扁桃体隐窝在扁桃体里可以形成10-20条，隐窝比较长。如果隐窝有炎症会在扁桃体被膜后引起扁桃体周围炎、扁桃体脓肿。扁桃体发炎的患者如果出现张口困难，说明扁桃体被膜后有炎症，要到医院看病。