尿道下裂手术是唯一的治疗方式，其手术方式有上百种，但是因尿瘘、尿道狭窄等并发症的发生率较高，目前来看治疗效果并不尽如人意。对于前型或中型的尿道下裂，畸形率比较轻，可以考虑一期手术；对于重度的尿道下裂，如阴茎阴囊型或会阴型的尿道下裂，伴有较严重的阴茎下曲，主张分两期做手术。第一期进行阴茎下曲的矫正，预埋好第二次手术腹侧的皮瓣，半年后做第二期的尿道板卷管尿道成形术，然后阴茎头成形术。对于重度尿道下裂的手术主张分两期做，可以使形态更美观。