鼻窦炎微创手术后通常会有后遗症。鼻窦炎是耳鼻喉科常见病，临床多数鼻窦炎首选药物保守治疗。但部分患者有鼻腔结构异常或鼻息肉，或经治疗以后症状不缓解，需要进行手术治疗。目前鼻窦炎手术基本是在鼻内镜下进行的微创手术，手术较普及，安全性较高，但仍有并发症或后遗症的存在。

可能因手术水平或鼻窦病情较严重，导致术中损伤周围结构如眶纸板，会引起眶内并发症，以及内直肌损伤、眶内感染等，可能会引起视力下降甚至失明。如果损伤颅底，可能导致颅内感染、脑脊液鼻漏等。因此鼻窦炎术后要按时复查，处理鼻腔的干痂等分泌物，还有囊泡、肉芽等，如果处理不及时，可能导致鼻腔粘连，以及鼻窦炎术后复发。