子宫肌瘤和巧克力囊肿不一样，子宫肌瘤和巧克力囊肿区别主要就是部位的不同。另外，子宫肌瘤就是平滑肌瘤，但是巧克力囊肿里面就是积血，这种积血造成了巧克力样的物质，故名为巧克力囊肿，但实际上巧克力囊肿就是陈旧性的出血，并没有深刻的含义。

1、子宫肌瘤：子宫肌瘤是长在子宫上，子宫肌瘤是最常见的子宫的良性肿瘤，一般都是良性的病变，其恶变率非常低，基本上就在0.4%左右，251个女性的卵巢子宫肌瘤患者才会恶变1个，所以基本上可以认为子宫肌瘤的恶变率比较低。所以在绝经之前，没有特殊的情况就没有必要做手术，或者没有必要尽快做手术；

2、巧克力囊肿：巧克力囊肿实际上是来源于子宫内膜，但是其长在左侧或者右侧的附件上，或者是在其他部位形成的囊肿，叫巧克力囊肿。巧克力囊肿真正的原因还是应该认为异位的内膜形成的出血，这种出血绝大多数都良性的问题，也有一部分巧克力囊肿容易恶变。