通常胃食管反流可选择手术治疗。约90%胃食道反流病可以通过药物治疗或改变生活方式治愈，而10%以上的胃食道反流患者需手术解决。国际上治疗胃食管反流的金标准是外科手术，尤其是腹腔镜外科手术。

通过外科手术可以修补可能并发的食道裂孔，也可尽量延长食道食管腹段，可以做折叠，以增加食道下段括约肌压力，折叠360°或折叠270°、180°，可加固食道下段括约肌压力防止反流，这是唯一针对胃食管反流病发病机制而采取的治疗。