脑神经损伤部分患者能完全恢复，与治疗时机、损伤严重程度有关。对于部分脑神经损伤，包括缺血性、炎症性脑神经损伤或外伤性因素，需及时去除造成损伤的因素。脑梗急性期可给予溶栓、取栓治疗，若由压迫引起需去除压迫，外伤性因素可通过手术进行修复，炎症需给予抗感染、抗病毒、激素等治疗，早期有效治疗、去除病因，可以为后续康复奠定基础。
大部分患者可通过积极的治疗，使用营养神经药物包括神经节苷脂、鼠神经生长因子、脑蛋白水解物等，促进神经修复。通过积极康复锻炼，可以形成新的神经环路，替代功能障碍的神经组织，可有效恢复功能作用。部分患者损伤范围较小可以完全恢复，损伤范围较大的患者，通过新的神经环路可替代原来80%-90%的功能。较少患者可能会残留后遗症，主要表现为运动和感觉功能障碍，此类患者不能完全恢复。
