虹膜角膜内皮综合征目前没有特效的治愈办法，只能进行对症处理，因此虹膜角膜内皮综合征无法治愈，只能达到临床的治愈。
因为虹膜角膜内皮综合征的根本问题是发生角膜内皮异常、虹膜基质萎缩、眼球虹膜周边部黏连，引起继发青光眼。因此，发生虹膜角膜内皮综合征时，进行相应处理。
角膜内皮如果异常，出现大泡性水肿，进行药物处理。超过半年的药物处理不能缓解角膜水肿，就进行角膜移植，甚至可以进行组分移植，即角膜内皮移植。
当虹膜周边部粘连，房角关闭，激发青光眼，这时发生眼压高，患者出现剧烈头痛、恶心、呕吐，且视力不下降，就进行青光眼的处理。
临床上青光眼的处理效果明显，药物控制稳定以后进行手术。青光眼的手术现在发展得越来越多，而且手术后的成功率较高。虹膜角膜内皮综合征多数发生在单眼，尤其是发生在白人，我国很罕见，因此虹膜角膜内皮综合征并不需要过于担心。
