扁桃体炎引起口臭可以根治，但需根据扁桃体炎控制情况而定，若控制较好通常口臭可以根治。若慢性扁桃体炎患者没有频繁发作，仅表现为扁桃体腺窝内有分泌物和角化物质，患者可每天早晚使用淡盐水漱口并保持咽腔内清洁。饮食方面尽量减少油腻和辛辣刺激食物摄入，多饮水、多食用新鲜蔬菜水果和蛋白含量丰富食物，以增强机体抵抗力。

通过上述措施可有效缓解症状，若患者可以避免反复感冒，则扁桃体炎也不会反复发作，扁桃体慢性炎症也会逐渐得到好转，使口臭情况得到改善或根治。但如果扁桃体炎反复发作，患者每年扁桃体化脓水肿且高烧情况超过5次，可能对身体造成损害。同时口臭情况也不会得到缓解，因而建议患者行手术切除，术后由扁桃体炎所导致的口臭便可得到根治。