肺表面活性物质的替代治疗，是新生儿呼吸窘迫综合征的常规治疗手段。早期给药是治疗成败的关键，其方法是经过气管插管缓慢注入肺内，多数需要给药2-3次，只要患儿出现间歇性呼吸困难、呻吟、吸气性三凹征，就可以及早给药，并非等待胸片出现典型改变。
近几年提倡使用无创呼吸支持治疗RDS，机械通气这一呼吸支持形式可以挽救患儿生命，但是治疗策略应该尽可能地使用无创呼吸支持、气道正压通气，尽量避免使用机械通气，对严重的RDS或无创呼吸支持治疗失败的患儿才采用机械通气。
为了使新生儿呼吸窘迫综合征患儿获得最佳预后，另外还必须给予良好支持治疗，包括保暖、维持正常体温，适当液体疗法，良好营养支持和处理动脉导管开放以及循环支持，维持适当组织灌注。护理上包括保暖、气道管理，还有肺表面活性物质治疗时的管理和输液管道的护理。
