总体来说，如果是青年自身免疫性脑炎患者伴有良性肿瘤，而且早期发现，其治愈率会比较高。自身免疫性脑炎的治愈情况与年龄层以及病因相关，如果青年女性的盆腔核磁共振或者超声发现有卵巢畸胎瘤，畸胎瘤一般是良性肿瘤。这种情况首先可以进行肿瘤的切除以减少抗原的产生，其次可以应用免疫抑制性的药物，比如静点人免疫球蛋白进行抗体的中和和受体的封闭之后，这类患者的预后比较好。

对于老年人，有些患者表现为边缘叶脑炎，可能早期对肿瘤的筛查比较困难。如果发现肿瘤后再治疗自身免疫性脑炎，可能已经到了肿瘤的晚期，这种情况下预后相对比较差。