头颅CT检查辐射是存在的。每个人都有安全的辐射接触剂量，一般做几次CT检查不会引起功能性的异常。每人每年全身照射剂量，在5mSv以下都是安全剂量，而一次CT的剂量可能小于等于0.1mSv。检查以后食用海带、绿豆汤、绿茶等，促进射线的排出，减少辐射损伤。
随着医疗技术的不断发展，已经提出了低剂量的扫描方案，即在其它扫描参数不变的情况下，降低管电压以达到诊断要求，使受检者的辐射剂量相应减低；低剂量的扫描方案，是常规扫描方案的剂量的1/10左右，有时甚至达到将近1/20，所以在这个辐射剂量下是非常安全的。
