自发性气胸的后遗症主要是气胸复发，因为自发性气胸的患者往往有很多肺大疱受损，如果患者的肺大疱相对比较集中，手术将肺大疱切除，则可能后期复发的几率就比较小。

但是很多患者往往存在很多肺大疱，如果只是把自发性气胸中已经破裂的肺大疱切除，但是剩下的一些肺大疱可能还会重新破裂，并且出现气胸。所以，医生术前最担心的就是复发的问题。