一般情况下椎动脉起始于双侧锁骨下动脉，起始位置叫起始段。起始段因跟锁骨下动脉有分叉，所以起始段是最常出现病变的一段。检测过程中，起始段发生闭塞或重度狭窄几率高。

起始段进入第六颈椎横突孔之前的称为V1段，叫做颈段。V2段叫横突段，是从第六横突孔一直上行至第二横突孔段。V3段从第二颈椎横突孔出口伸向脊椎段，叫做寰椎翻转。根据生理结构寰椎翻转弯曲可以转。V4段是颅内段，就是从硬脑膜孔穿梭至基底动脉起始段，叫V4段。