扁桃体发炎的原因有较多，通常存在以下几种原因：

1、感染性因素：可分为病毒感染和细菌感染，而病毒感染俗称为上呼吸道感染。感冒引起的扁桃体炎，多称之为急性扁桃体炎，多和β-溶血性链球菌的感染有关。而细菌感染所引起的扁桃体炎，如化脓性扁桃体炎，症状通常较重，可能引起体温的升高；

2、免疫性因素：免疫功能紊乱或者免疫功能低下时，人体容易外邪侵袭，导致扁桃体发炎。主要因为口咽部、扁桃体都不是无菌环境，在扁桃体隐窝内，有较多正常口咽部细菌的定植。当人体免疫功能下降，机体处于劣势、弱的时候，细菌、病毒可能引发扁桃体实质的炎症；

3、周围病变：周围其他部位病变蔓延所致，比较常见的鼻炎、鼻窦炎、智齿冠周炎、口底炎，都可以引发扁桃体炎。