绝大多数的手术后结核性脓胸患者，恢复都比较好，无明显后遗症。对于脓胸时间比较长，手术过程中发现肺组织质量比较差的患者，行脓胸纤维板剥脱术后，患者的肺组织有破口，术后可出现支气管胸膜瘘，这一类患者则会出现相应的后遗症。

出现支气管胸膜瘘后需要长期换药，对于患者生活的影响比较大。这一类患者术后长时间引流以后做了胸廓成形手术，这类手术会减掉很多根肋骨，对患者胸廓的外形，以及整个人体的外形影响比较大，这是脓胸手术之后比较麻烦的一个问题。