通常十二指肠溃疡的患者，癌变较为罕见。如果十二指肠溃疡给予规范诊断、规范治疗，通常90%以上的患者可以达到症状缓解、黏膜愈合，所以通常无需担心十二指肠溃疡癌变。由于十二指肠属于小肠，而小肠环境决定其癌变概率较小。

但是如果是胃溃疡，则需要鉴别情况，即部分患者在胃溃疡基础上隐含胃癌。所以十二指肠溃疡的患者，通常给予规范治疗，包括抑制胃酸，如质子泵抑制剂，配合黏膜保护剂。如果存在幽门螺杆菌感染，给予规范四联疗法，大部分患者均可以愈合。