肠镜和胃镜是一根镜子，实际上胃镜是通过镜子进去之后观察的。一般胃镜是通过大夫操作一根镜子，经过嘴或者经过鼻腔到食道，进入食道之后通过食道以及通过胃和食管中间的连接部位贲门，然后到达胃；到胃里再观察整个胃的全貌，包括胃底、胃体、胃角、胃窦，然后通过胃窦和十二指肠之间的幽门，通过幽门之后观察十二指肠球以及进入十二指肠降段，观察乳头区域。胃镜主要是通过口腔或者通过鼻腔之后进入观察整个食道全貌、胃全貌和十二指肠的一部分。
肠镜实际上也是一根镜子从肛门进去，一般在直肠通过肛门之后，第一部分是直肠，直肠再往上是乙状结肠，乙状结肠往上依次分别是降结肠、横结肠、升结肠到回盲部，有时患者同时需要观察回肠末端。所以结肠镜或者肠镜，观察的是整个结肠、直肠，包括回肠末端。
