子宫内膜异位症的患者通常存在痛经表现，而且痛经有进行性加重的特点，即一次比一次疼。子宫内膜如果异位到卵巢B超可以观察到卵巢巧克力样囊肿，即子宫内膜异位到卵巢。
随月经周期改变，每来一次月经，在卵巢内的子宫内膜就会出血，但血液无法流出，会沉积在卵巢内，导致卵巢体积越来越大，流出来血的颜色像巧克力，所以称为巧克力样囊肿。
子宫内膜还有可能异位在其它部位，此时通过B超就不一定能够诊断，因为B超是影像学检查，病灶需要达到一定大小时才能够发现。此时需要结合妇科检查，如三合诊或双合诊，再结合临床症状、B超检查，以及抽血查CA12-5，如果综合起来都存在异常即可诊断子宫内膜异位症。
