扁桃体反复发炎的危害比较严重，扁桃体是免疫器官，如果反反复复发生炎症，就会形成病灶性疾病，成了内在的致病器官，称为病灶性疾病，比如其可引起风湿性心脏病、风湿性关节炎、肾小球肾炎。

作为病灶型扁桃腺炎，是导致这些疾病最主要的病因，就像龋齿一样，这种风湿性疾病都是由这些疾病引起，所以扁桃体炎反反复复发作的时候，特别是每次发作都伴有发热、咽疼，患者不得不输液治疗的时候，一定要尽快把扁桃体切除。