儿童阴囊小原因较多，具体如下：

1、睾丸位于阴囊内后部位，对阴囊具有扩充作用。如果睾丸未在阴囊中，阴囊扁平，需及时就医进行专门体检，判断是否出现隐睾；

2、患儿肥胖：可能阴囊中脂肪较多，睾丸包括精索发育较差，需大量脂肪填充，可能出现阴囊较小现象；

3、部分患儿存在内分泌紊乱、激素分泌异常可能导致阴囊较小。