肛门检查是肛肠科的常规检查手段，主要有肛门视诊、指诊，以及肛门镜检查三个检查方式：

1、肛门视诊：是对肛门外观予以观察，观察肛门附近是否出现隆起的包块，是否出现红肿、出血、皮肤的病损情况，肛门的情况、肛门的外观是否异常，是否有对称、畸形、沾有大便等残留物、有肿物的情况；

2、肛门指诊：也称为直肠指诊，是通过手指触摸，检查肛门周围或肛门本身是否有触痛、是否有皮温的升高、是否有包块。同时在直肠内是否能摸到僵硬的组织、摸到新生物，是否存在血性、黏液情况。另外通过指诊可以简单的测试肛门的收缩功能，肛门以及会阴肌肉的协调配合情况，直肠内的压力情况；

3、肛门镜检查：是借助肛门镜进入到肛门，可以重点观察直肠和肛管的局部情况，可以看到是否存在红肿的炎症性表现、是否存在黏膜的糜烂溃疡、肿瘤、穿孔破溃等解剖结构、连续黏膜的脱垂、出血，有没有脓，大便中是否混有其他不良物质，直肠内有没有异物等情况。绝大多数肛肠的良性疾病，通过肛门外观的视诊，肛门直肠的指诊以及肛门镜检查，都能做出明确诊断。